Após derrotar as máquinas em seu combate inicial, Neo ainda vive na Nabucodonosor ao lado de Morpheus, Trinity e Link, o novo tripulante da nave. As máquinas estão realizando uma grande ofensiva contra Zion, onde 250 mil delas escavam rumo à cidade e podem alcançá-la em poucos dias. A Nabucodonosor é convocada para retornar a Zion e participar da reunião que definirá o contra-ataque para salvar a humanidade da extinção. Entretanto, um recado enviado pelo Oráculo faz com que Neo retorne à Matrix.
Meghan Miles é uma repórter que sonha em assumir a função de âncora de um telejornal. Quando seu desejo está prestes a ser realizado, uma louca e romântica noite lhe deixa vagando sozinha pelo centro de Los Angeles, sem documento, telefone, dinheiro ou carro. Meghan tem apenas oito horas para livrar-se dos problemas e comparecer a uma importante entrevista de emprego.
Hank Palmer, um advogado bem-sucedido e arrogante, retorna à sua pequena cidade natal para o velório da mãe. Ele descobre que seu pai, o respeitado juiz local Joseph Palmer, está sendo acusado de ter assassinado um antigo réu, que acabou de sair da prisão após, cumprir 20 anos na cadeia. Apesar de toda a frieza que há entre eles, Hank assume o caso e passa a defender o pai. Os dois precisam curar certas feridas e aceitar a dependência que Joseph, portador de Alzheimer, tem do filho.
Isabella está à espera do marido que está retornando aos Estados Unidos após uma conferência, mas, antes de desembarcar, Anwar El-Ibrahimi é retido por autoridades do governo e ninguém o encontra. Corrine Whitman, que investiga a morte de cidadãos americanos em um atentado terrorista, desconfia que ele esteja envolvido com um grupo perigoso no Egito, seu país natal. Anwar é levado para fora dos Estados Unidos, onde passa a ser torturado com o objetivo de revelar as informações que sabe.
Valerie é uma jovem que vive em um vilarejo aterrorizado por um lobisomem. Ela é apaixonada por Peter, embora seus pais insistam que ela case com Henry, filho de uma família rica do local. Diante da situação, Valerie e Peter planejam fugir, mas veem seus planos irem por água abaixo quando a irmã mais velha de Valerie é assassinada pelo lobisomem que ronda a região. Eles recorrem ao padre Solomon, um caçador famoso de monstros que adverte que a fera toma forma humana durante o dia.
A repórter Angela e o cinegrafista Scott estão fazendo uma matéria sobre os bombeiros que trabalham à noite em Los Angeles. Durante a gravação, eles recebem um chamado de emergência de um prédio onde a polícia investiga um relato de gritos horríveis. Lá, a equipe de TV e os bombeiros encontram uma senhora infectada por um vírus que transforma as pessoas em canibais. Eles ainda estão lá dentro quando as autoridades decidem lacrar o prédio e o ataque realmente começa.
Alice acorda misteriosamente em outra realidade, como se nada tivesse acontecido, mas as sequelas do vírus logo aparecem na forma de zumbis, e ela descobre fazer parte de um novo experimento. Nas instalações da Umbrella, Alice descobre que um antigo inimigo pode ser o segredo para salvar não só ela, mas também seus antigos companheiros de luta. Só existe um problema: Jill Valentine e Rain Ocampo, sob as ordens da poderosa Rainha Vermelha, não estão dispostas a facilitar as coisas para o grupo.
Hank Palmer, um advogado bem-sucedido e arrogante, retorna à sua pequena cidade natal para o velório da mãe. Ele descobre que seu pai, o respeitado juiz local Joseph Palmer, está sendo acusado de ter assassinado um antigo réu, que acabou de sair da prisão após, cumprir 20 anos na cadeia. Apesar de toda a frieza que há entre eles, Hank assume o caso e passa a defender o pai. Os dois precisam curar certas feridas e aceitar a dependência que Joseph, portador de Alzheimer, tem do filho.
Isabella está à espera do marido que está retornando aos Estados Unidos após uma conferência, mas, antes de desembarcar, Anwar El-Ibrahimi é retido por autoridades do governo e ninguém o encontra. Corrine Whitman, que investiga a morte de cidadãos americanos em um atentado terrorista, desconfia que ele esteja envolvido com um grupo perigoso no Egito, seu país natal. Anwar é levado para fora dos Estados Unidos, onde passa a ser torturado com o objetivo de revelar as informações que sabe.